Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9030612E09RikQ8CE20 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms