Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc63Q8CDV6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc63Q8CDV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc63Q8CDV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms