Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc38Q8CDN8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms