Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc87Q8CDL9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc87Q8CDL9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms