Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Phf20l1Q8CCJ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf20l1Q8CCJ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms