Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nhlrc3Q8CCH2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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