Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podxl2Q8CAE9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Podxl2Q8CAE9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Podxl2Q8CAE9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms