Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Spef2Q8C9J3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spef2Q8C9J3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms