Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Srsf12Q8C8K3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srsf12Q8C8K3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf12Q8C8K3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms