Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dclre1bQ8C7W7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms