Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q8C3W1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q8C3W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q8C3W1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q8C3W1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms