Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csgalnact2Q8C1F4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms