Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp37Q8C0R0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp37Q8C0R0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms