Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Strip1Q8C079 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strip1Q8C079 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms