Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdh12Q8BYK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rdh12Q8BYK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms