Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp38Q8BW70 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp38Q8BW70 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp38Q8BW70 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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