Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod1Q8BVA4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod1Q8BVA4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms