Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTR5

Dusp28, Dual specificity phosphatase 28, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp28Q8BTR5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp28Q8BTR5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp28Q8BTR5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dusp28Q8BTR5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dusp28Q8BTR5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dusp28Q8BTR5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dusp28Q8BTR5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dusp28Q8BTR5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dusp28Q8BTR5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms