Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cep55Q8BT07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep55Q8BT07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep55Q8BT07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms