Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cc2d1bQ8BRN9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cc2d1bQ8BRN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cc2d1bQ8BRN9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms