Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rd3Q8BRE0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rd3Q8BRE0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rd3Q8BRE0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms