Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip4Q8BQP8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip4Q8BQP8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms