Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LsampQ8BLK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LsampQ8BLK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LsampQ8BLK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms