Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hirip3Q8BLH7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hirip3Q8BLH7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hirip3Q8BLH7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms