Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd55Q8BLD6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms