Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp54Q8BL06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp54Q8BL06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp54Q8BL06 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp54Q8BL06 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms