Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc2Q8BKV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc2Q8BKV1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms