Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem87bQ8BKU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem87bQ8BKU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem87bQ8BKU8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms