Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fndc9Q8BJN4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms