Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcal1Q8BJL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcal1Q8BJL0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms