Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chtf18Q8BIW9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chtf18Q8BIW9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chtf18Q8BIW9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chtf18Q8BIW9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chtf18Q8BIW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chtf18Q8BIW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chtf18Q8BIW9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms