Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prune1Q8BIW1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prune1Q8BIW1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prune1Q8BIW1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms