Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
D130040H23RikQ8BII3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms