Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra5Q8BHJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra5Q8BHJ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms