Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timm29Q8BGX2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timm29Q8BGX2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timm29Q8BGX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms