Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samm50Q8BGH2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samm50Q8BGH2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samm50Q8BGH2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms