Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htatsf1Q8BGC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htatsf1Q8BGC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms