Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnb1Q8BG40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnb1Q8BG40 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnb1Q8BG40 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Katnb1Q8BG40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms