Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2bQ8BG39 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sv2bQ8BG39 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms