Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Jmjd4Q8BFT6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd4Q8BFT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Jmjd4Q8BFT6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd4Q8BFT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms