Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4cQ811C2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4cQ811C2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4cQ811C2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms