Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39bQ810L4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39bQ810L4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms