Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zer1Q80ZJ6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms