Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TnnQ80Z71 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnnQ80Z71 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
TnnQ80Z71 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnnQ80Z71 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms