Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stkld1Q80YS9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stkld1Q80YS9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms