Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Thnsl2Q80W22 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Thnsl2Q80W22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms