Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap1Q80UJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab3gap1Q80UJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms