Protein–RNA interactions for Protein: Q80TN7

Nav3, Neuron navigator 3, mousemouse

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Length 2,359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav3Q80TN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nav3Q80TN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nav3Q80TN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nav3Q80TN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nav3Q80TN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Nav3Q80TN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nav3Q80TN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nav3Q80TN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nav3Q80TN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nav3Q80TN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nav3Q80TN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nav3Q80TN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms