Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf8Q80TJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms