Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atf7ipQ7TT18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atf7ipQ7TT18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms